Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZY0

Sfi1, Protein SFI1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfi1Q3UZY0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfi1Q3UZY0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfi1Q3UZY0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms