Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Znf48Q3US17 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Znf48Q3US17 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Znf48Q3US17 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Znf48Q3US17 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Znf48Q3US17 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Znf48Q3US17 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
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