Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Tmem253Q3UNB8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Tmem253Q3UNB8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Tmem253Q3UNB8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Tmem253Q3UNB8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Tmem253Q3UNB8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Tmem253Q3UNB8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Tmem253Q3UNB8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmem253Q3UNB8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms