Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms