Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms