Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms