Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Nkx6-3Q3UHX8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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