Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Arfgef3Q3UGY8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms