Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 A330043C09Rik-201ENSMUST00000139823 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap22-2-201ENSMUST00000178913 380 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms