Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc174Q3U155 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc174Q3U155 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms