Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Palb2Q3U0P1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms