Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trappc9Q3U0M1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms