Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms