Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ctdnep1Q3TP92 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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