Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc10Q3TLI0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms