Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usp39Q3TIX9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp39Q3TIX9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp39Q3TIX9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp39Q3TIX9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp39Q3TIX9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp39Q3TIX9 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp39Q3TIX9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp39Q3TIX9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp39Q3TIX9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp39Q3TIX9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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