Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2f1Q3THK3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms