Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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