Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rpusd3Q14AI6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rpusd3Q14AI6 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rpusd3Q14AI6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rpusd3Q14AI6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rpusd3Q14AI6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rpusd3Q14AI6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rpusd3Q14AI6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rpusd3Q14AI6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rpusd3Q14AI6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rpusd3Q14AI6 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rpusd3Q14AI6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rpusd3Q14AI6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rpusd3Q14AI6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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