Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc162pQ0VG85 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms