Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Ttc39dQ0VF76 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttc39dQ0VF76 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Ttc39dQ0VF76 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Ttc39dQ0VF76 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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Ttc39dQ0VF76 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Ttc39dQ0VF76 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Ttc39dQ0VF76 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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