Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc1Q0VDN7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms