Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms