Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spata18Q0P557 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spata18Q0P557 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms