Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pate4Q09098 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms