Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
1700061G19RikQ08EE8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1700061G19RikQ08EE8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1700061G19RikQ08EE8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
1700061G19RikQ08EE8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1700061G19RikQ08EE8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1700061G19RikQ08EE8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1700061G19RikQ08EE8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
1700061G19RikQ08EE8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1700061G19RikQ08EE8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1700061G19RikQ08EE8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
1700061G19RikQ08EE8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
1700061G19RikQ08EE8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
1700061G19RikQ08EE8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
1700061G19RikQ08EE8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
1700061G19RikQ08EE8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
1700061G19RikQ08EE8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
1700061G19RikQ08EE8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
1700061G19RikQ08EE8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
1700061G19RikQ08EE8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
1700061G19RikQ08EE8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms