Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tff1Q08423 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Tff1Q08423 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Tff1Q08423 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Tff1Q08423 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Tff1Q08423 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tff1Q08423 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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