Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ranbp1-201ENSMUST00000052325 923 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms