Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms