Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms