Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff2Q03404 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tff2Q03404 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tff2Q03404 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tff2Q03404 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tff2Q03404 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tff2Q03404 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tff2Q03404 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Tff2Q03404 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms