Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a2Q02788 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms