Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NfiaQ02780 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms