Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GscQ02591 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GscQ02591 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GscQ02591 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms