Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RykQ01887 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RykQ01887 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
RykQ01887 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
RykQ01887 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
RykQ01887 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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