Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms