Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GabpaQ00422 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms