Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms