Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp1P97350 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp1P97350 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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