Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
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Mesp1P97309 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Mesp1P97309 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Mesp1P97309 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Mesp1P97309 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms