Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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