Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx3P81067 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx3P81067 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx3P81067 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx3P81067 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx3P81067 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx3P81067 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms