Protein–RNA interactions for Protein: P62932

Fbxo40, F-box only protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo40P62932 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo40P62932 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms