Protein–RNA interactions for Protein: P62918

Rpl8, 60S ribosomal protein L8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl8P62918 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl8P62918 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl8P62918 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms