Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd1P62315 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms