Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrch1P62046 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrch1P62046 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms