Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smg6P61406 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg6P61406 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms