Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms