Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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