Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace1P56818 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bace1P56818 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bace1P56818 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms